Wrth i Feirws Ffrwythau Rwgo Tomato Brown heintio planhigion tomatos a phupur ledled y byd, mae cwmnïau hadau yn gweithio ar fridio tomato ag ymwrthedd.
Roedd adnoddau genetig a genomig cyfoethog ar gael i fridwyr tomatos hyd yn oed cyn i brosiectau dilyniannu genomig y tomatos ddechrau. Mae casgliadau germplasm tomato mawr wedi'u hen sefydlu mewn sawl lleoliad. Mae mwy na 75,000 o dderbyniadau tomatos yn cael eu cadw mewn banciau genynnau ledled y byd. Un o'r rhai mwyaf yw banc genynnau USDA yn Genefa, NY.
Dechreuwyd dilyniannu'r genom tomato yn 2005 fel ymdrech amlwladol rhwng 14 gwlad ac fe'i cwblhawyd yn 2012. Mae'r ymdrechion hyn wedi'u cyflymu'n fawr gyda chymhwyso deallusrwydd artiffisial, dysgu peiriannau ac algorithmau uwch i ddadansoddi symiau mawr o ddata genetig a ffenoteipaidd.
Pan-genom Tomato
Creodd ymchwilwyr o Sefydliad Boyce Thompson yn 2020 genom cyfeirio o ansawdd uchel ar gyfer tomatos gwyllt i gynhyrchu pan-genom tomato mwy cyflawn a defnyddiol. Fe wnaethon nhw ddarganfod rhannau o'r genom sy'n sail i flas ffrwythau, maint ac aeddfedu, goddefgarwch straen ac ymwrthedd i glefydau. Diolch yn rhannol i dechnolegau dilyniannu blaengar sy'n gallu darllen darnau hir iawn o DNA, mae'r genom cyfeirio yn fwy cyflawn a chywir na'r gronfa ddata bresennol.
Mae technolegau dilyniannu hŷn sy'n darllen darnau byrrach o DNA yn nodi treigladau ar y lefel sylfaen sengl. Fodd bynnag, nid ydynt yn dda am ddod o hyd i amrywiadau adeileddol megis mewnosod, dileadau, gwrthdroadau neu ddyblygiadau darnau mawr o DNA.
Yn 2019, adeiladodd grŵp rhyngwladol o ymchwilwyr pan-genom tomato gan ddefnyddio dilyniannau genom o 725 o fathau cynrychioliadol ffylogenetig a daearyddol. Mae'r gronfa ddata hon yn cynnwys 4,873 o enynnau nas canfuwyd yn y genom cyfeirio gwreiddiol. Datgelodd dadansoddiadau amrywiadau presennol/absennol golled sylweddol o enynnau a detholiad negyddol dwys o enynnau a hyrwyddwyr yn ystod dofi a gwella tomatos.
Darllenwch yr erthygl gyflawn yn www.seedworld.com.